“中国政府船只接连两天入侵日本海域”，26日成为日本媒体的关注焦点。共同社称，日本时间26日下午4时50分左右，日本海上自卫队侦察机在钓鱼岛地区的久场岛东北偏北约145公里海域发现中国“科学3号”海洋调查船。日本第11管区海上保安总部称，“科学3号”的航行区域“和预先通报的不同”，进入了“日本专属经济区”，船尾有线缆深入海中。约一小时后，“科学3号”进入“预先通报区域”。
另据《读卖新闻》报道，25日下午，中国“北斗”号海洋调查船也曾出现在钓鱼岛附近海域，进行了类似活动。面对日本“海保”的“警告”，“北斗”号回应说“中方船只航行海域在合法范围内，且已向日方通报，航行活动无可非议”。
据报道，中日两国此前曾达成协议，在两国接壤海域进行调查活动需要提前两个月进行相互通报。但日本外务省25日晚照会中方称，“北斗”的此次调查活动虽然提前通报了日方，但“实际调查地点和所通报的地点不符合”，“不认可任何此前未经同意的调查活动”。《朝日新闻》26日称，中国曾在今年六七月份通报将在冲绳海域进行科学调查，日本以“不进行矿产资源的探查”为条件同意了中方要求。
《产经新闻》26日称，这已是中国官方船只年内第二次“入侵日本海域”。时事通讯社26日说，从中国海洋调查船的航行和船缆下沉作业来看，这是针对海洋大陆架地层结构进行的系统调查，表明中方正在有计划地对该海域进行“资源探查”。日本富士电视台称，中方是在“越界探查该地区的油气和稀有金属资源”。朝日电视台26日还威胁称，按照计划，中日首脑互访将在年内进行，但是“不排除因东海上的紧张事态而向后拖延的可能”。
